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Humanos vivendo na Vila dos Humanos.
Os Humanos (人間, ningen) de Gensokyo são fisicamente similares aos humanos do nosso mundo, mas são notavelmente diferentes em termos de habilidade. Nos tempos antigos, bravos humanos que sabiam lidar com entidades sobrenaturais, viajaram para uma área infestada de youkais que que hoje nós chamamos de Gensokyo. Lá se estabeleceram com o objetivo de observar os youkais e impedí-los de aterrorizar o restante do país. Esses notáveis humanos frequentemente lutavam contra os youkais. Um dia, Gensokyo foi separado do resto do mundo. Assim, tendo sido separado do resto da humanidade, os humanos em Gensokyo ignoraram os avanços científicos e desenvolveram um formidável poder espiritual inato para sobreviverem. Hoje, um humano normal de Gensokyo é provavelmente mais forte que um youkai comum, mas a população youkai é muito maior que a dos humanos. A maioria dos humanos vive na Vila dos Humanos, mas outros poucos vivem em diferentes locais.
Naturalmente, existem humanos excepcionais que podem lutar de igual para igual contra as criaturas mais poderosas de Gensokyo.
- Exemplos: Reimu Hakurei, Marisa Kirisame, Sanae Kochiya, Sakuya Izayoi, Fujiwara no Mokou, Rikako Asakura, Rika, Hieda no Akyu, Layla Prismriver, Yumemi Okazaki, Kotohime, Meira, Chiyuri Kitashirakawa, Myouren Hijiri, Gates, Hirano Sakurasaki, Lagunas, Marie, Mei and Mai, Miria, Morgan, The Tri Stars, Yuuta Kirishima
Muitos outros personagens são mestiços: (Meio humano e meio outra espécie).
- Exemplos: Rinnosuke Morichika, Youmu Konpaku, Youki Konpaku, Keine Kamishirasawa
Maribel Han e Renko Usami são estrangeiras, humanos vivendo fora do mundo de Gensokyo. Veja também o artigo de Perfect Memento in Strict Sense sobre Estrangeiros.